肉鸡饲养过程中，无论上批鸡发病与否，鸡舍内都会残留病原体，污染环境。如果不彻底消灭这些病原体，很容易感染下一批鸡。因此，做好空舍消毒工作，使每批鸡都有一个干净卫生的生活环境，才能杜绝各种疾病的循环传播。
1.清理鸡舍
清舍速度要快，清理要彻底。饲养设备，如料桶、饮水器、塑料网、灯泡、温湿度计、工作服及其他用具等，应搬到舍外。彻底清除鸡粪、羽毛、煤灰等污物，清扫房顶、墙壁和门窗等，做到舍内无尘。
2.清洗鸡舍
清洗地面、墙壁和门窗等，舍内用具、设备用消毒药浸泡后，用清水冲洗干净、晒干；要求鸡舍地面无积水，舍内任何表面都要冲洗到位，无死角，无污物附着。特别注意房顶的灰尘，要由上而下清洗干净。设备及地面干燥后，方可消毒。
3.检修工作
维修鸡舍设备、修补网床、检修电路和供热设备。设备至少能保证再养一批鸡，否则应予以更换，损坏的灯泡要全部换掉，最好使用节能灯泡。
4.治理舍外环境
清除舍外排水沟杂物；清除鸡舍四周杂草；做到排水畅通，不影响通风。修理舍外道路和清扫厂区，做到无鸡粪、羽毛、垃圾。
5.鸡舍消毒
把设备和用具搬进鸡舍，关闭门窗和通风孔。要求做到封闭严密不漏风，喷洒消毒，消毒后10小时后通风，通风3-4小时后，关闭门窗。鸡舍所有表面顶棚墙壁、网床，应选用高效、无腐蚀性的消毒药消毒，按说明书比例配制。地面消毒应选用3%热火碱水喷洒或撒生石灰。
6.熏蒸消毒
关闭门窗和通风口，检查温度和湿度是否符合要求。最好选用固体甲醛与高锰酸钾熏蒸法。具体要求是舍温24℃，湿度80%。上述熏蒸药物按鸡舍面积计算，如高锰酸钾21克、福尔马林42毫升、水21毫升。走廊每隔10米做一个熏蒸盆，盆内放高锰酸钾，加水搅匀。然后从舍内最远端依次快速倒入福尔马林，完成后立即把门封严。空舍消毒期间不得有人、动物进入鸡舍，熏蒸后24-36小时打开门窗和通气孔，充分换气。